Factorul IX al coagularii este sintetizat in ficat sub influenta vitaminei K. Factorii activatori XI (XIa) sau VII (VIIa) pot activa factorul IX al coagularii. Antitrombina (AT) este principalul inhibitor al factorului IXa. Aceasta inhibare este amplificata in prezenta heparinei.
Deficienta de factor IX este legata de sexul pacientului si produce hemofilie B, tratata prin inlocuirea factorului IX.