Nivelurile scăzute de CH50, C3 și C4 ar putea rezulta fie din hipercatabolizarea proteinelor complementului în bolile asociate cu complexe imune cum ar fi lupusul eritematos sistemic (SLE), vasculita, crioglobulinemia asociată cu hepatita C, hepatita B, glomerulonefrita (GN), infecția pneumococică si sepsis gram-negativ sau din scăderea sintezei proteinelor complementare datorate deficiențelor de complementare moștenite, afecțiunilor hepatice severe sau malnutriției.
Valorile crescute ale valorilor CH50, C3 și C4 pot să apară în contextul inflamației sistemice, deoarece proteinele complementare sunt sintetizate ca parte a răspunsului în fază acută în bolile țesutului conjunctiv incluzând, dar fără a se limita la SLE și artrita reumatoidă (RA), infecții bacteriene și virale și alte boli cum ar fi cancerul, diabetul zaharat și infarctul miocardic. În plus, stările hipermetabolice, cum ar fi hipertiroidismul și sarcina, pot fi asociate cu o creștere a valorii CH50.